תחזוקת אקווריום מים מלוחים שונה במקצת ממקבילו המתוק.
למרות שמדובר בשתי מערכות התומכות ומתיימרות לספק את כל צרכיהם
של השוכנים ב אקווריום , ישנם הבדלים (חלקם מהותיים) בין השניים.
הפרלון.
את הסינון המכאני מבצע צמר הפרלון.
שאריות אוכל שלא נאכל , הפרשות ה דגים , רפש וכו' כל אלו מסוננים ע"י הפרלון.
את הפרלון ב אקווריום מים מלוחים יש להחליף ולא לבצע לו שטיפה ולהחזיר אותו למערכת הסינון .
ישנם לא מעט חובבים שנוהגים כך במערכות מים מתוקים, שם הדבר נסבל אם כי לא מומלץ .
במערכת מים מלוחים יש לזרוק את הפרלון המשומש ולהחליפו בחדש !
המדיה הביולוגית.
המדיה הביולוגית הנפוצה במערכת מלוחה עשויה לרוב משברי אלמוגים ,
להם יש שטח פנים גדול ביחס לנפחם.
האקרופות נחשבות לאייכותיות ביותר מבין האלמוגים "היבשים" למטרה זו.
מדיה פופולארית נוספת הם כדורי הביובולס המשמשים בעיקר בתא הרטוב יבש בסאמפ.
יש לזכור שבמערכת מים מלוחים בשונה ממערכת מתוקה המסלעה עצמה מהווה
חלק נכבד ממערכת הסינון הביולוגית של ה אקווריום.
לשם כך כמובן יש לדאוג לזרימות נאותות המושגות ע"י משאבות גלים וראשי כח
המופנים לכיוון המסלעה.
במידה ומתעורר הצורך לנקות את המדיה הביולוגית , הדבר נעשה אך ורק ע"י
מים מהאקווריום וזאת על מנת לשמר את מושבות הבקטריות האירוביות
שהתפתחו במשך הזמן על המדיה.
כושר הסינון של פרלון משומש נמוך מכושר הסינון של פרלון חדש ,
גם אם מדובר מהסוג המשובח ביותר !
סיבה נוספת היא הצטברות של ניטראט ופוספאט , הפרלון משמש כחממה להתפתחות
של פוספאט וניטראט ויש להימנע מהצטברותם במערכת.
לכן יש להחליף את הפרלון במערכת מים מלוחים אחת למספר ימים שבוע לכל היותר.
זאת כמובן בהתאם לכמות ולסוג האוכלוסיה.
במערכות ריף , חלק מן החובבים מוותרים לחלוטין על השימוש בפרלון ומסתמכים
על מדיה ביולוגית צפופה כסינון מכאני !
וזאת בכדי להימנע מהצטברות של פוספאט וניטראט.